Heart of Stone, zorlu bir görevle karşı karşıya olan bir ajanın hikayesini konu ediyor. Rachel Stone, kendini barışı korumaya adamış çok uluslu güçlü bir istihbarat teşkilatı olan The Charter'da ajan olarak çalışan bir kadındır. Rachel, zor bir görevle karşı karşıyadır. Parker ve Jack'in dahil olduğu ekibiyle birlikte Rachel, bir bilgisayar korsanının örgütün en değerli ve en tehlikeli silahının çalınmasını önlemek için zorlu bir mücadeleye girişir.